Den 16. februar 2016 beordret en amerikansk føderal dommer Apple til å hjelpe FBI med å hacke inn iPhonen som eies av Syed Farook, en av skytterne i desember 2015 angrep i San Bernardino.

FBI ba Apple om å lage en versjon av iOS som både vil deaktivere passordsikkerhetsfunksjoner og tillate at passord legges inn elektronisk, slik at det deretter kan brutalt tvinge passordet på enheten.

Apple kunngjorde at de ville motsette seg ordren i et åpent brev skrevet av Tim Cook, som sa at FBIs forespørsel ville skape en 'farlig presedens' med alvorlige implikasjoner for fremtiden for smarttelefonkryptering. Apple sa at programvaren FBI ba om kunne tjene som en 'hovednøkkel' som kan brukes til å få informasjon fra hvilken som helst iPhone eller iPad - inkludert de nyeste enhetene - mens FBI hevdet at de bare ønsket tilgang til en enkelt iPhone.

Apples tvist med FBI endte 28. mars 2016 etter at regjeringen fant en alternativ måte å få tilgang til dataene på iPhone ved hjelp av det israelske firmaet Cellebrite og trakk søksmålet.